在當(dāng)前經(jīng)濟(jì)社會(huì)中，獸藥殘留的檢測主要集中在動(dòng)物源食品的品控以及監(jiān)管（包括：養(yǎng)殖、粗加工、加工以及上架整個(gè)流程的各個(gè)環(huán)節(jié)）、乳制品、水體水質(zhì)監(jiān)測等。

　　在政府監(jiān)管上，我國現(xiàn)在強(qiáng)調(diào)：從源頭抓起！所以，首要就是農(nóng)業(yè)部下屬的獸藥監(jiān)察所、動(dòng)物疾控中心、農(nóng)科院、水產(chǎn)所等，然后就是出入境檢驗(yàn)檢疫局、檢科院、各地疾控中心（食品風(fēng)險(xiǎn)監(jiān)測）、食品安全風(fēng)險(xiǎn)中心、水利局，還有成立不久的食品藥品監(jiān)督管理局。

　　獸藥殘留的檢測與我們熟知的農(nóng)藥殘留的檢測相比，含量更低、毒性當(dāng)量更大、代謝物更多。所以，對檢測的儀器、人員要求更高。一般來說各地的獸藥監(jiān)察所、進(jìn)出口檢驗(yàn)檢疫局、疾控中心、乳制品企業(yè)對于獸藥殘留的檢測開展的早，儀器、人員水平高經(jīng)驗(yàn)足，尤其是對于遵從法規(guī)的定量檢測，有著豐富的經(jīng)驗(yàn)。大型肉制品生產(chǎn)企業(yè)，這兩年，在目標(biāo)獸藥殘留方面的檢測能力，也不容小看。

　　但是，目前還有一些問題：一是養(yǎng)殖企業(yè)中的獸藥殘留監(jiān)管還不廣泛；其次水質(zhì)監(jiān)測上還沒有涉及獸藥殘留檢測，這主要是由于藥廠排污、養(yǎng)殖企業(yè)將病死禽畜拋入河流等帶來的獸藥污染；再有就是目前的獸藥殘留監(jiān)管只是針對標(biāo)準(zhǔn)中規(guī)定的那幾項(xiàng)，然而獸藥的代謝化合物和轉(zhuǎn)換物的監(jiān)管還有待提高；*后非法獸藥添加的及時(shí)發(fā)現(xiàn)與鑒定，未知監(jiān)管范圍內(nèi)的獸藥殘留毒性當(dāng)量研究還有待深入。

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